2022-11-23
一、韦恩图 / upset图 / 花瓣图介绍
1.1 韦恩图
韦恩图是一种用于显示集合重叠区域的关系图表,通过图形之间的重叠来反映数据集之间的相交关系。主要用于展示 2-5 个分组。
1.2 upset图
upset图 展示多个集合之间的共有或特有元素,主要用于展示 3-7 组(目前设置最大的是7组)。
1.3 花瓣图
花瓣图主要用于展示各个样品独有以及共有的元素个数分布情况,主要用于展示6个以上分组。
二、在微生物多样性分析中的应用
2.1 进入绘图界面
若是基因云项目用户,可以通过项目中心相应项目编号,进入微生物群落多样性组成谱分析系统页面,找到【 物种差异与标志物种分析 → ASV/OTU韦恩图 】这一章节,进行绘图使用。
若是非基因云项目用户,可以在首页云分析模块,通过点击【立即体验】按钮进入相应章节绘图界面,体验试用哦。
2.2 调整参数
图表调整提供花瓣宽度以及中心透明度等调整参数。
切换不同图表类型为经典韦恩图、齿轮韦恩图和花瓣图。
三、在转录组分析中的应用
3.1 进入绘图页面
若是基因云项目用户,可以通过项目中心相应项目编号,进入真核有参转录组分析系统页面,找到【 表达差异分析 → 差异基因韦恩图 】这一章节,进行绘图使用。
若是非基因云项目用户,可以在首页云分析模块,通过点击【立即体验】按钮进入相应章节绘图界面,体验试用哦。
3.2 图表切换
可切换花瓣图、韦恩图和upset图。
3.3 upset图解
下图以各比较组之间基因差异表达情况为例,upset图详细展示了两两比较组间独有的及共有的差异基因数目。
三个比较组:A_vs_B、A_vsC、B_vs_C;
左边柱子:展示了3个比较组各自的差异基因数目;
上边柱子:需结合右下方交集点图查看。以第一根柱子为例,展示了A_vs_C和B_vs_C两个比较组之间共有的差异基因数目;以第二根柱子为例,展示了A_vs_C独有的差异基因数目。
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