2023-01-02
新年新气象,值此元旦佳节。派森诺基因云平台,重磅推出微生物宏基因组分析可视化系统。该系统集内容全面、分析专业、操作高效、方法创新以及突破性的数据集展现形式等特点于一体,助您科研再攀高峰。下面跟随小编一起提前了解看看吧!
一、个性化Genes集和Reads集创建 微生物宏基因组分析可视化系统同时支持基于Genes集和Reads集数据的分析和操作。下面以创建Genes集为例,一起看看如何创建个性化Genes集吧。 1.1 物种/功能的剔除和保留 我们可以依据研究目的,对关注或不关注的物种或功能,进行保留或剔除进而过滤相应序列。 其实质是基于科研需求,结合物种、功能等注释信息,对基因序列进行过滤的过程 。 1.2 创建Genes集 第一步填写Genes集基本信息,便于后续对Genes集进行管理。 第二步搭建流程,根据需求在基因、物种、功能三个过滤模块中,选择需要进行基因集过滤的注释依据 。 第三步配置流程。在物种功能数据可视化界面中,选中或剔除关注,或不关注的物种或功能。 1.3 管理Genes集 完成配置流程后,可以点击运行按钮来启动标准分析流程。另外还支持对Genes集进行配置、删除、查看配置等操作。
二、14大主流功能数据库 微生物宏基因组分析可视化系统支持14大主流功能数据库,提供更加全面的物种功能解读。 功能数据库可以在功能分析相关章节右侧分析设置中进行调整,下面以功能组成分析为例,可切换不同数据库提交分析。
三、物种差异分析图表解析 3.1 分析参数的调整 宏基因组分析可视化系统还推出专业化的物种/功能差异分析模块。该模块支持基于分组方案设计,并可依据分组和数据类型,提供多种不同数据格式转换、数据处理、差异检验、事后检验、P值校正方法等诸多参数调整项。 3.2 分析结果展示 差异分析的结果支持柱状图、森林图、箱线图、小提琴图+箱线图等多种形式和P值的个性化分面呈现。
四、部分分析结果图表秀 微生物宏基因组分析提供各式各样新颖图表,帮助您发表科研论文增添亮点,下面是摘选的部分图表,包括物种/功能CIRCOS 、层次聚类分析 、关联网络分析、LEfSe分析 、物种贡献度分析。