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这款工具带你一键搞定差异分析和可视化

2023-01-13

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一、图表说明

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通过提琴箱线组合图或柱形图加显著性星号形式展示不同组样品之间的差异,并支持使用不同统计检验方法评价差异是否显著。


二、数据准备


2.1、数据文件与分组文件

数据文件以物种在样品中丰度值为例,第一列为物种名,第二列开始为物种在各样品中的丰度值分组文件第一列为样品名称,第二列为分组名称,第一列样品名称需要和数据文件中第一行样品名称一致。

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三、图形解读

图形分为三部分:

左图:数据分布情况或均值;

中图:事后检验结果。当数据为两组时不支持做事后检验,中图展示为误差线;

右图:各组间差异比较结果P值,P值越小,差异越显著。

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如下图,以物种在两组样品中丰度情况为例。左图柱状图表示每个物种在不同样品组中丰度均值,中图用误差线展示95%置信区间,右图P值为该物种在两个样品组中差异显著P值。

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四、图表设置


4.1、图表类型

可切换左图为提琴箱线组合图、提琴图、箱线图或者柱形图四种图表类型。

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五、数据设置


5.1、事后检验

可选择多组比较时是否做事后检验。当选择不做事后检验时,图只展示两部分;两组比较时不支持做事后检验。

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5.2、检验比较方法

  • 多组比较时提供Kruskal-Wallis test和ANOVA两种方法;

  • 两组比较时提供Wilcoxon test和Student's test两种方法;

  • 当选择系统推荐方法时,该工具会对数据进行正态性检验,如果数据满足正态分布,两组比较自动选择Student's test方法,多组比较自动选择ANOVA方法。

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