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一起看看热图+柱状图双强组合如何解锁新功能?

2023-01-18

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一、图表说明


通过热图柱状图组合的形式展示数据特征,从而更加直观反映样品/组内或组间的差异。热图可用于展示物种在样品中的丰度值、基因在样品中的表达量等数据,柱状图可用于展示物种对于分类器模型的重要性打分值、基因表达差异倍数等。

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二、数据准备


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2.1 数据文件

以物种在样品中的丰度为例,第一列为物种名,第二列至倒数第二例为物种在样品中丰度值经过取对数/标准化/无处理后得到的计算值,最后一列为物种对于分类器模型的重要性打分值。

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2.2 分组文件(非必需)

第一列为样品名,必须和数据文件中第一行样本名一一对应,第二列为样品分组信息。分组文件为绘图的非必需文件,如果上传分组文件则在热图上方可选择是否显示分组方块。

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三、图形解读


下面以物种丰度用随机森林算法分析结果为例,一起看看这款工具的实际应用:

热图:展示分类单元名在各样品/各分组中的丰度值(通常对丰度值按行取对数/标准化/不处理)。纵坐标为在门、纲、目、科、属或种水平的分类单元名,横坐标为样品名。

柱状图:展示物种对于分类器模型的重要性打分值柱子越长表示物种对模型的重要性打分值越大,表明该物种对组间/组内物种鉴定的重要性越大,据此可认为这些重要性打分值较大的物种是组间差异的标志物种

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四、图表设置



4.1 图表颜色

可自定义设置热图图表颜色,分组颜色(上传分组文件时可调整),以及柱形图的颜色。颜色组合丰富,任您搭配使用。

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4.2 显示分组

当绘图上传了分组文件时,可选择是否在热图上方显示表示样品分组信息的方块。如果没有上传分组文件,图表设置中不显示该调整项。

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4.3 调整热图宽高

该工具还支持热图单元格的宽度高度调整,可以根据不同电脑屏幕分辨率大小,灵活调整图表至最佳展示效果。

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