2023-02-15
今天我们要介绍的是基因密度图，该图表通过热图和密度图组合的形式，来展示指定窗口内基因组DNA所含的基因数目或基因密度分布情况。具体图表解析请听我娓娓道来~
一、图形解读 热图 当统计方式选择百分比：它展示每个窗口中与之有重叠的基因重叠部分长度之和 / 窗口大小。颜色越接近蓝色表示基因分布越密集，反之基因分布越稀疏。 当统计方式选择绝对数：它展示每个窗口中与之有重叠的基因个数。颜色越接近蓝色表示基因分布越密集，反之基因分布越稀疏。 密度图 展示基因密度趋势。每个窗口对应的峰越高，表示基因分布越密集，反之基因分布越稀疏。密度图起伏高低与热图颜色红绿渐变相对应。
二、图表调整参数 2.1、调整窗口大小 可设置将染色体划分为指定大小的交叠窗口，来统计这些交叠窗口内基因的密度。 2.2、染色体间距设置 当染色体之间分布过于密集的时候，我们可以调整间距让图表更加舒展。 2.3、图表颜色设置 可设置热图图表与密度图图表的颜色。
三、数据要求 染色体文件 染色体文件第一列为染色体名称，第二列为染色体起始位置，第三列为染色体终止位置。三列信息位置固定不可调整。 基因文件 基因文件第一列为基因所在染色体名称，第二列为基因起始位置，第三列为基因终止位置。三列信息位置固定不可调整。
四、其他图表 除基因密度图外，我们还有适用于通用数据的组合密度图，它的图表样式也是非常多样化的，大家可以去尝试一下。
