2023-03-15
差异统计检验是科学研究的重要组成部分,其分析结果可用于检验我们实验结果的真实性、准确性和可重复性。派森诺基因云推出的小工具——差异检验箱线图,理论上可用于任何数据的差异检验分析。 例如,对于微生物组研究,我们可以用差异检验箱线图对不同物种的丰度或功能基因的含量进行组间差异统计检验,还可以比较Alpha多样性指数的差异大小等等,适用的绘图场景很多,一起来看看吧。
一、图表解读 每组至少3个样本,每列数据对应一个箱线图子图。 P值:展示Kruskal-Wallis非参数检验获得的组间总体差异的P值。 *号:展示各组之间Dunn's test事后两两比较获得的差异显著性水平(*,P<0.05;**,P<0.01;***,P<0.001)。 带端点的横线:代表是横线两端的两组之间的比较。
二、数据获得途径 1. 通过云分析系统获取 ★ 如果您是云分析项目用户,首先找到云分析模块,进入微生物群落多样性组成谱分析系统页面,通过点击【立即体验】按钮进入分析界面,找到【 序列处理分析 → 物种分类学注释 】这一章节,分别下载数据文件和分组文件,然后在云图汇中上传使用。 0:06 分组文件下载与处理: 分组文件下载之后,需要删除多余的样本列数据,然后导出文件即可。:04 2. 其他途径 ★ 当然,除了从分析系统导出数据,差异检验箱线图同样支持其他途径数据,只要符合规定的绘图数据格式即可。 第一列为样本名称,其他列为相关变量名称。 分组文件: 第一列为样本名称,第二列为分组名称。调整分组文件中的分组顺序,就等于调整图形中分组的实际显示顺序。
三、图表调整 面板宽度 合理地调整图表面板宽度,可以展示更好的图表效果。