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一图胜千言:探究关联热图在分析中的应用

2023-03-22

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关联热图是一种强大的数据分析工具,它可以帮助用户发现数据之间的相似性差异性相关性,用于分析物种丰度、生化指标或影响因子之间的相关性


一、图表解读

如下图所示:

图例:展示相关性系数值,其中红色代表正相关蓝色代表负相关颜色深浅表示相关性强弱

*号:展示显著性值*:P<0.05;**:P<0.01;***:P<0.001)。

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二、参数调整

2.1 算法说明

Spearman等级相关系数:非参数统计方法,适用于非正态分布的数据。(比如微生物数据,默认推荐spearman);

Pearson相关性系数:适用于符合正态分布的变量;

Kendall秩相关系数:适用于有序分类变量。

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2.2 P值和R值的调整

P值:两个变量关联的显著性。P值越小,表示两个变量之间的关联越显著。

R值:两个变量之间的相关性强度。R值的绝对值越大,表示两个变量越相关。

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2.3 星标(关联显著性)

可以调整星标的水平、颜色与大小,还可以控制星标是否在图表中显示。

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三、图表样式

关联热图单元格样式可调整为:圆形、椭圆、数字、饼图、阴影、方形


四、其它使用事项

当出现如下图所示的情况,我们可以适当调整筛选条件,例如调整相关性算法或将相关系数R值调小,同时将p值筛选调大。如果经过调整后仍然无法得到显著的关联性,则说明在设定参数条件下,数据中可能不存在具有显著关联的数据记录。

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