2023-03-24
今年年初派森诺迎来一位新的“悍将”，它就是Illumina NextSeqTM 2000！（《派森诺再添一员“悍将”—NextSeqTM 2000，高通量测序服务能力又上新台阶》）从下图官方提供的测序系统性能参数来看，NextSeqTM 2000在PE300模式中有着比MiSeq更高的测序质量和测序通量，以及更短的测序周期，这让我们在扩增子长片段研究中看到了更多的希望，也让我们在测序领域中看到了更广阔的前景！
接下来小编抑制不住激动的心情，向各位展示派森诺NextSeqTM 2000测序系统PE300实测数据及分析结果，让我们一睹为快吧~
本次测试我们平行比较了相同文库样品分别在NextSeq_PE300与MiSeq_PE300以及NextSeq_PE300与NovaSeq_PE250中的表现，总结为以下几点：
一、数据质量
NextSeq下机数据R1端碱基质量分布图
NextSeq下机数据R2端碱基质量分布图
NextSeq测试数据质量表格
✅从以上数据图表可以发现，NextSeq_PE300结果数据质量更高，碱基质量Q30平均可以达到90%左右，远远高出官方提供标准，数据利用率也会大幅提升；
二、数据分析结果展示
NovaSeq与NextSeq——门和属水平物种相对丰度柱形图
MiSeq与NextSeq——门和属水平物种相对丰度柱形图
✅无论是门水平还是属水平物种组成分析结果，都可以看出，几种测序平台得到的物种组成及丰度分布保持高度一致，优势物种分布无差别；
NovaSeq与NextSeq——Alpha多样性分析结果
MiSeq与NextSeq——Alpha多样性分析结果
✅Alpha多样性分析结果显示，几种测序平台间样品内微生物的丰度程度及多样性程度基本一致；
NovaSeq与NextSeq——Beta多样性分析结果
MiSeq与NextSeq——Beta多样性分析结果
✅同时，Beta多样性分析结果显示，几种测序平台的同一样品物种组成及丰度分布基本一致，且高度相关。
上述结果表明，作为Illumina测序系统中的拥有长度长模式的“新贵”，NextSeq平台不仅能获得和NovaSeq与MiSeq平台高度一致的菌群组成结构，而且在测序质量上，也相比Q30>70%的MiSeq PE300模式官方质控标准，有了大幅提升！更重要的是，NextSeq的测序通量至少是MiSeq平台的4倍以上，能轻而易举的实现大样品量、高测序量的长片段样品，对于低丰度物种的探测、以及菌群整体组成的分辨率也将更精细！
