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单细胞测序悬浮液制备专题-眼角膜组织

2023-08-03

前言

眼睛、一个美丽而神奇的器官。

人类眼睛内部的眼球近似球状,由眼球壁和眼内容物构成。人的眼球壁由外至内依次为纤维膜、血管膜、视网膜。角膜作为眼球壁组成部分,是弯曲度大于眼球外壁其他部分的透明圆盘状结构;正常人角膜中央薄(约0.5mm)周边厚(约1.0mm);角膜由无血管的结缔组织构成;含有丰富的神经末梢。


一、眼角膜结构简介

人的角膜分为五层,由前向后依次为:角膜上皮(corneal epithelium)、前界层(anterior limiting lamina )、角膜基质(corneal stroma)、后界层( posterior limiting lamina )、角膜内皮(corneal endothelium)。

由于角膜的特殊构成,在解离过程中会出现细胞量较少且脆弱容易凋亡的情况。经过测试优化,小派提供一种高效、稳定的角膜组织解离方案,可获得活性好、总量多、背景干净的单细胞悬液。


二、解离方案

1、提前配制复合酶解离液(含木瓜蛋白酶、DNase Ⅰ等)及蛋白酶抑制剂。

2、从组织保存液中取出角膜组织样本,放入预冷的 DPBS中清洗。

3、将清洗后的组织放到复合酶解离液中,用眼科剪将组织剪成碎片状,转移至含有剩余解离液的50ml离心管中,置于37℃水浴中震荡消化 30-90 min,期间可使用巴氏吸管轻柔吹打组织,使其充分接触解离液。

4、消化结束后,解离液通过 40um 细胞筛进行过滤,收集通过的细胞滤液至一新的无菌离心管中。

5、4℃,300 xg 离心 5 min,弃上清。向细胞沉淀中加入含蛋白酶抑制剂和DNaseⅠ的培养基重悬细胞,再通过低速离心,获得背景干净的细胞。

6、加入适量DPBS(含 2%FBS)重悬细胞,取20uL细胞悬液进行细胞计数和活力测定。(注:AOPI荧光计数、台盼蓝染色镜检)


三、结果展示

角膜组织

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(注:新鲜组织短时间内取出,尽快放入到组织保存液,送到实验室)

镜检结果

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单细胞悬液背景干净,细胞状态好

活性、浓度检测

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细胞活性95%,浓度655个/ul,总量在15W以上。

数据质控

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上图是下机数据cellranger质控结果,细胞捕获数及基因数都符合前期需求。