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单细胞测序悬浮液制备专题——人股骨头组织

2024-01-15

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一、股骨结构简介

股骨又称为大腿骨,是人全身中最长的长骨,分一体两端,其近侧端存在圆形股骨头;股骨头极为重要,人的直立行走、活动劳动都要依靠股骨头的支撑作用。之前小派与大家分享了小鼠股骨的解离方法,相信大家肯定都收获颇丰吧!今天继续给大家带来人的股骨头解离实验方案及结果展示。 


二、人股骨头组织解离方案

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人股骨头组织

1、实验试剂配置

(1)适当体积复合酶液 

(2)含2% FBS的DPBS,冰上预冷 

(3)完全培养基:含10% FBS的DMEM

2、预处理

从组织保存液中取出组织样本,放入预冷的 DPBS中清洗一到两遍,使用眼科剪将组织尽可能的剪切成1~2mm³,用预冷的DPBS清洗组织块。

3、初次消化

将剪碎的组织转移至复合酶液中,置于37℃水浴中振荡消化5 min,完全培养基终止消化,过30um细胞筛收集悬液,置于冰上暂存。

4、二次消化

将上步过筛处理后剩余组织转入新管复合酶液继续消化20min,完全培养基终止消化,过30um细胞筛收集,置于冰上暂存。

5、三次消化

重复上步,计数仪测定细胞悬液浓度,无明显细胞量产出时,终止消化。

6、清洗

将所有细胞悬液合并后4℃ 400×g 离心5 min,弃上清,加入适当体积DPBS(含2% FBS)重悬沉淀,进行荧光计数及台盼蓝镜检。

(若离心后发现底部沉淀呈现红色,需要进行裂红处理。若出现活率不足80%,需要进行去除死细胞处理。若出现碎片较多,则需要进行去碎片操作。)


三、结果展示

镜检结果

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背景干净,形态完整。

活性、浓度检测

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94%活率,浓度645个cells/ul,总量20W以上。

数据质控

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上图是下机数据cellranger质控结果,细胞捕获数及基因数都符合前期需求。