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一文满足您对单细胞基因表达量UMAP图展示的所有需求

2024-02-04

1、单基因表达量分布umap图

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NKG7基因在分群图中表达情况分布(左:0值为灰色,右:0值为蓝色)。颜色深浅表示表达值的高低。


2、单基因表达密度分布umap图

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NKG7基因在分群图中表达密度分布(左右为不同色板展示结果)。颜色深浅表示密度高低。


3、多基因表达密度分布umap图

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IL7R和CCR7基因在分群图中表达密度分布。颜色深浅表示密度高低。


4、高亮单基因表达量超过指定阈值的细胞

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MS4A1表达量超过指定阈值的umap分布图(上左图)。高亮的点表示高表达MS4A1的细胞。灰色点表示表达量低于阈值的细胞。IL7R表达量超过指定阈值的umap分布图(上右图)。高亮的点表示高表达IL7R的细胞灰。灰色点表示表达量低于阈值的细胞。


5、高亮多基因表达量超过阈值的细胞

MS4A1和GZMB表达量超过指定阈值的umap分布图。高亮的点表示分别高表达MS4A1和GZMB基因的细胞。灰色点表示表达量低于阈值的细胞。

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参考:https://samuel-marsh.github.io/scCustomize/index.html