首页> 关于我们 >新闻中心>技术分享>新闻详情

微生物组测序解决方案——样本制备之粪便样本

2024-02-29

粪便的微生物组研究中常用到微生物多样性组成谱测序以及宏基因组测序,其中微生物多样性测序是通过对16S/18S/ITS 等微生物菌群特征序列的扩增及高通量测序,并结合专业的生物信息分析,快速准确地鉴定样本中微生物( 细菌/ 古菌/真菌等 )的物种组成和多样性,并同时获得群落进化关系、物种结构、群落功能等多种生物信息;而宏基因组测序则是对环境中所有微生物的完整基因组进行测序,相较于微生物多样性测序,宏基因组更加注重微生物功能水平的研究,在获取微生物功能基因序列信息的基础上,更有希望获得样本中单菌基因组的全部信息。

但是,一切都建立在合适的样本制备方法基础之上。若样本不合格,那再完美的解决方案也无法解决科研问题。因此,样本的制备是关键中的关键。对于粪便样本,该如何有效采集和存储才能保证实验结果的准确性呢?


粪便样本采集前注意事项

1、一周内使用过抗生素不建议采样

2、痔疮活动期不可采样

3、女性月经期间不可采样

4、稀便和水样便不建议采样

5、采样时尿液和水不可混入粪便

6、确保实验数据准确性,采样时注意所使用耗材均为无菌产品

7、粪便样本最好在4小时之内全部收集完毕,并迅速转移至超低温冰箱储存,建议转移过程在低温环境下完成


粪便样本采集操作步骤

1、粪便样本采集

使用无菌粪便收集器或其他灭菌器皿收集粪便样本,用无菌牙签或粪便取样器挖取样本中段里部(粪便表层含有肠粘膜脱落细胞,外部易污染,且接触空气后,部分细菌DNA开始降解)。

2.粪便样本取样量

单个样本取样量:0.5~1.5 g/管。为保证实验数据充足,每个样本建议取3-5管备份(根据实验需求留取备份即可)。

3.粪便样本保存

为防止微生物发生变化,须及时将粪便放入-80℃冰箱冻存。

4.粪便样本运输

寄送样本时选择干冰或足量冰袋运输,确保寄送到实验室时,样本仍处在冷冻状态。

但是很多情况下粪便样本的采集不在实验室,不能及时放入低温环境下保存,所以需要一款常温下即可保存粪便样本的保存液。因此上海派森诺生物自主研发了微生物样本常温保存液,并推出了粪便样本采集套装,旨在最大限度地保持样本中微生物的多样性。

1.jpg

2.jpg


产品特点

  • 可以在常温下采集、保存人和动物粪便样本,保护样本中微生物DNA不被降解;

  • 使用简单,快速取样;

  • 采样管及保存液均为无菌产品,减少样本污染;

  • 从保存液中提取的微生物DNA,后续可用于酶切和PCR等多种分子生物学实验,以及宏基因组和微生物多样性测序等。


保存期限

常温25℃条件下粪便样本可在保存液中储存30天。


上述指南提供了一般性的建议。对于具体的产品和服务,建议参考上海派森诺生物科技股份有限公司提供的详细说明和操作手册,以确保样本的采集、保存和运输符合最佳实践标准,并最大限度地保持微生物的完整性和多样性。


粪便样本微生物采样工具套装可洽询当地销售或拨打咨询电话:021-80118168-6720