2016-01-07
简介：
梨小食心虫为重要的寡食性害虫，分布范围较广，对梨树嫩叶及果实等部位为害严重。梨小食心虫除危害梨、桃树外，也危害李、杏、苹果、山楂等，严重影响果品质量及梨果产量。梨小食心虫成虫触角在寻找寄主植物、交配、产卵等过程中发挥重要作用。西北农林科技大学植物保护资源和害虫管理实验室的仵均祥教授和他的团队以梨小食心虫触角做为样本进行转录组测序，鉴定嗅觉相关基因。结果共鉴定出124个嗅觉相关基因，其中118个基因为该物种中新发现的，包括28个编码气味结合蛋白的转录本，17个化学感受蛋白，48个气味感受器，4个味觉感受器，24个亲离子受体，2个感觉神经膜蛋白及1个气味降解酶。
派森诺生物测序项目文章：梨小食心虫转录组测序。文章研究为今后害虫味觉识别的研究提供了分子研究基础，特别是为使用化学信息素控制害虫提供了可行性。该研究成果Identificationof Putative Olfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis于2015年11月5日发表在PLoS ONE（影响因子3.234）杂志上。梨小食心虫的转录组测序及信息分析工作，由上海派森诺生物科技股份有限公司完成。
方法：
用棉签蘸5%蜂蜜溶液喂养雌幼虫，对3-4天后刚羽化的1200个飞蛾的触角进行转录组测序
测序平台：
Illumina MiSeq 平台
分析内容：
1. 共有基因和基因分析
2. 基因表达差异分析
3. 聚类分析
4. eggNOG注释
5. KEGG注释
6. qPCR验证
结果：
共鉴定出124个嗅觉相关基因，其中118个基因为该物种中新发现的，包括28个编码气味结合蛋白的转录本，17个化学感受蛋白，48个气味感受器，4个味觉感受器，24个亲离子受体，2个感觉神经膜蛋白及1个气味降解酶。
图1 转录组数据不同比对方式比较
图2 OBP及CSP基因系统发生树构建
图3 梨小食心虫转录组测序GO基因功能注释
参考文献;
Guangwei Li, Juan Du. Identification of PutativeOlfactory Genes from the Oriental Fruit Moth Grapholita Molesta via an Antennal Transcriptome Analysis. PLoS One. (2015)1-30.
原文索引：10.1371/journal.pone.0142193
本文由派森诺生物技术支持徐宁宁整理
