2018-07-10
miRNA在前列腺癌（PCa）进展中具有重要作用，一些miRNA已被鉴定为PCa中潜在的癌基因或肿瘤抑制因子。本文作者研究了miR-34家族成员miR-34b和miR-34c在不同PCa细胞系中的表达，并讨论了miR-34b在体外侵袭和迁移PCa细胞中的分子机制。DU145和PC3细胞系之间转录组差异分析表明miR-34b和miR-34c都靶向参与代谢的关键途径，例如增殖，迁移和侵袭。
RNA-seq材料：DU145和PC3细胞系
测序平台：Illumina
测序公司：上海派森诺生物科技股份有限公司
一些研究证实，DU145和PC3分别是具有中度和高转移潜能的PCa细胞系，为确保这两种细胞系适合用于后续实验，作者通过对迁移和侵袭能力的测定来证明细胞侵入细胞外基质的转移能力，结果表明DU145和PC3分别是具有中度和高转移潜能的PCa细胞系（图1）。
图1 两种前列腺癌细胞迁移和侵袭能力的比较
为鉴定miRNA在PCa细胞中的差异表达，在DU145和PC3细胞中进行了miRNA测序分析。通过热图分析表明，与PC3细胞相比，DU145细胞中miR-34b和miR-34c的表达显着更高（图2A）。使用miRNA测序（图2B）和通过qRT-PCR（图2C）在DU145和PC3细胞中研究miR-34家族的三个成员的表达水平。发现miR-34家族的三个成员的表达水平显示出与miRNA发现的相同的趋势测序，表明miR-34b和miR-34c可能参与前列腺癌转移。且数据表明miR-34b和miR-34c的表达水平与转移灶呈负相关PCa的潜力。
图2 DU145和PC3中miR-34a，miR-34b和miR-34c的表达水平
紧接着作者进行了一系列的实验来说明miR-34b和miR-34c的功能。细胞增殖和生长实验结果证明miR-34b和miR-34c抑制PCa细胞增殖。迁移和侵袭实验结果表明miR-34b和miR-34c的过表达降低了较高转移性PC3细胞的迁移和侵袭能力。
图3 miR-34b和miR-34c均抑制PCa细胞增殖
小RNA测序结果中靶基因的KEGG富集分析显示，miR-34b的靶基因中涉及的主要信号传导途径包括：TGF-β信号传导途径，轴突导向途径，肌动蛋白细胞骨架调控途径，MAPK信号通路等（图4）。在本文中作者关注TGF-β信号通路。用miR-34b / c模拟物和模拟NC转染PC3细胞，结果表明miR-34b在转录水平上不调节TGF-β信号传导途径，但在蛋白质水平上显着抑制TGF-β。本文证明了TGF-β信号通路可能是miR-34b调节PCa细胞迁移和侵袭的关键靶点。
图4 KEGG富集分析表明miR-34b在前列腺癌细胞中的作用途径
参考文献：
LL Fang et al. Int J Mol Sci (2017)
Potent Inhibition of miR-34b on Migration and Invasion in Metastatic Prostate Cancer Cells by Regulating the TGF-β Pathway.
影响因子：3.687
转录组调控事业部 王慧敏
2018年7月10
