2019-06-04
斑马鱼由于具有繁殖能力强、体外受精和发育、胚胎透明、性成熟周期短、个体小易养殖等诸多特点，使其成为功能基因组时代生命科学研究中重要的模式脊椎动物之一。在短短一周内，由派森诺助力的两篇斑马鱼文章相继被发表，影响因子分别为5.587与3.884。这些研究将RNA-Seq与small RNA-Seq应用到分子调控机制的研究当中，解释了斑马鱼性腺发育调控机制与毒素反应机理。
Article 1
由派森诺与上海海洋大学合作发表于《Stem Cells》，影响因子5.587。
研究背景
生育和内分泌功能依赖于下丘脑-垂体性腺(HPG)轴的紧密同步调节，性腺是性类固醇激素和生殖细胞的主要来源。为了在整个生命周期中保持荷尔蒙平衡和生育能力，诱导性腺干细胞更新是一个有吸引力的策略。FSH /cAMP/ MAPK /Sox9信号轴及其调控的特异性miRNA被认为是调节脊椎动物性腺的发育和性别分化，然而调控网络在很大程度上是未知的。
研究思路
研究结论
小分子RNA和小分子cocktail能够操纵干细胞和分化细胞的细胞命运和可塑性。然而,表型性腺的转化需要多种体细胞和生殖系统的复杂协调。本研究进行全基因组转录组挖掘，以确定miRNA-mRNA对在斑马鱼睾丸发育和卵泡发育调控中的作用。然后进行了性腺显微注射，发现了两个特异性miRNA-GPCR-Sox9a/- Sox9b网络在调节性腺分化和更新。预测未来的研究将数以百计本研究中发现的其他miRNA-GPCRs靶对，这不仅有助于我们了解miRNA在调控细胞命运可塑性方面的分子机制，还为进一步研究miRNA在调控细胞命运可塑性方面的作用以及寻找新的性腺再生治疗靶点的方法奠定了基础。
Article 2
由派森诺与武汉大学合作发表于《Aquatic Toxicology》，影响因子3.884。
研究背景
微囊藻毒素(MC-LR)是一种剧毒的肝毒素，对水生生物乃至人体健康都有极大的危害。斑马鱼肝细胞系(ZFL)是研究毒物毒性和代谢的重要模型。然而，MC-LR的毒性及其对ZFL细胞基因转录的影响仍有待研究。
研究思路
研究结论
本文研究了斑马鱼肝脏细胞对MC-LR的转录反应。大量的MC-LR调控基因和选择性剪接事件被发现。对基因转录数据进行共表达模组分析MC-LR转录反应的复杂性。MC-LR对生物过程和细胞信号通路的影响具有高度的时间依赖性。利用基因转录数据构建了一个基因调控网络，并确定了潜在的hub基因。研究结果阐明了MC-LR细胞毒性的分子机制，以及MC-LR毒性的转录组结构下的基因调控回路。
参考文献
1、Guo H, Du X, Zhang Y, et al. Specific miRNA‐GPCR networks regulate Sox9a/Sox9b activities to promote gonadal rejuvenation in zebrafish[J]. STEM CELLS, 2019.
2、Lu X, Tian J, Wen H, et al. Microcystin-LR-regulated transcriptome dynamics in ZFL cells[J]. Aquatic Toxicology, 2019, 212: 222-232.
