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转录组测序:解码水果保鲜的“基因语言”

2025-05-11

水果从枝头到餐桌,如何保持新鲜?采后储藏是决定水果品质和经济效益的关键环节。随着科技发展,转录组测序技术正成为研究水果耐储藏的“利器”,它能从基因层面揭示水果衰老、软化和抗冷害的奥秘,为保鲜技术提供精准靶点!

河南科技学院园艺与园林学院发表2篇甜柿冷藏保鲜相关研究的文章,文中RNA-seq测序以及部分分析工作由上海派森诺生物科技股份有限公司完成

文章一

Glycine betaine treatment: Effects on alleviating chilling injury and related gene expression in ‘Youhou’ sweet persimmon during cold storage

杂志:Journal of Food Science

时间:2025-02-14

链接:https://doi.org/10.1111/1750-3841.70047

文章主题:甘氨酸甜菜碱处理甜柿可有效防止冷藏期间的冷害发生以延长储存期。

组学技术:RNA-seq

文章要点:转录组测序分析表明甘氨酸甜菜碱处理显著改变了甜柿的糖代谢、GSH代谢和苯丙烷类物质合成等相关基因的表达,为研究甜菜碱的冷藏保鲜作用机制提供了新思路。

技术路线

转录组结果展示

CK_vs_GB转录组分析

(a.样本相关性;b.差异火山图;c. DEG聚类热图;d.KEGG富集分析;e.差异转录组因子热图)

文章二

Treatment with 24-epibrassinolide protects ‘Youhou’ sweet persimmon fruit against chilling injury during cold storage

杂志:Scientia Horticulturae

时间:2025-03-19

链接:https://doi.org/10.1016/j.scienta.2025.114087

文章主题:24-表芸苔素(EBR)内酯处理甜柿可提高抗氧化能力、防止冷害。

组学技术:RNA-seq

文章要点:EBR处理通过降低MDA含量和电解质相对渗漏率,降低ROS积累水平,提高AsA、GSH和花青素含量来缓解阳丰甜柿冷害。EBR处理同时还提高了PAL活性,降低了POD和PPO活性水平。此外,通过转录组测序结果显示,EBR处理改变了与植物激素信号转导、花色素苷生物合成、油菜素类固醇生物合成、糖代谢、苯丙素类生物合成、氧化应激和脂肪酸代谢等相关基因的表达水平

技术路线

转录组结果展示

CK_vs_EBR转录组结果

(A.样本相关性;B.差异火山图;C. DEG聚类热图;D.KEGG富集分析)

植物激素信号转导和抗寒相关DEG

(A.通路热图;B.转录因子热图;C.抗寒基因热图)