2017-08-10
派森诺生物再次与中国科学院南京土壤研究所合作,在《Soil Biology & Biochemistry》(影响因子4.857)上发表文章,揭示生物碳改良剂对稻田土壤排放N2O气体的促进作用。
研究背景
在农耕作物中,氮肥一直是被大量需求并广泛应用的肥料。但是由于氮肥的大量使用,现已造成了大气中N2O含量的持续增加。而在农耕土壤中,稻田土壤被认为是主要的大气N2O来源之一,因此,建立有效的农业温室气体减排管理方法迫在眉睫。
研究目的
在前人的研究中发现,生物碳改良剂能有效减少农耕土壤温室气体的排放量,并加强土壤的固碳能力、肥性以及增加作物产量,但是它对水稻田N2O气体排放情况的影响还不明确。本研究旨在从以下两方面探究生物碳改良剂对水稻田N2O气体排放量的影响:小麦秸秆来源的生物碳改良剂对水稻田中N2O形成的相关基因丰度的影响,以及对具有相关功能的微生物类群的群落结构的影响,为研究生物碳改良剂对农耕稻田土壤温室气体N2O排放量的影响奠定了一定的科学基础。
研究方法
测序技术:454 FLX平台
测序模式:细菌的amoA功能基因
实验对象:土壤样品
实验设计:取0~20cm处的水稻和小麦轮作土壤,风干后过2mm的网目筛;并取小麦秸秆经过烘干—慢热降解后过2mm的网目筛制成生物碳,将土壤、生物碳、N肥分为6个处理,每个处理4个生物学重复,进行实验室培养实验,在各个时间阶段进行理化性质测定,并对第14d的各组样品进行高通量测序:Control组(非热降解生物碳对照组)、1%biochar组(热降解率为1%的生物碳)、4% biochar组(热降解率为4%的生物碳)、Urea组(加尿素的无机N肥)、1% biochar+urea组(加尿素无机N肥和热降解1%的biochar混合物)、4% biochar+urea组(加尿素无机N肥和热降解4%的biochar混合物)。
研究结果
对不同处理组的样品进行理化性质测定、N2O气体排放量的测定、相关功能基因amoA,nirK,nirS及nosZ的定量PCR检测及细菌amoA基因进行高通量测序,得到如下结果:
对45天内不同处理样品的N2O气体排放情况进行检测,发现4% biochar、Urea、1% biochar+urea、4% biochar+urea四个组从第10天起N2O气体通量开始增加,并在第14天时达到各自峰值;并且由45天内各组N2O气体的累积排放量可知,4% biochar+urea组是最多的,与其他组具有显著差异。
对生物碳、N肥的添加以及它们同时添加对N2O气体排放情况、N2O气体形成相关功能基因丰度的影响进行ANOVA方差分析,由结果表格可知,Biochar×N fertilizer对N2O气体的排放有着关键的促进作用。
对45天内6个处理不同阶段的PH值进行测量,由折线图可知在前14天除了control组,其他组的PH值都有显著增加,而在14天之后又急剧下降,并且除了4% biochar组外,各组的PH值都逐渐达到4.5左右的稳定值。
对45天内无机N的含量进行检测,由折线图可知,在加N肥和不加N肥的处理之间,NH4+离子浓度并没有显著差异,并且在不加N肥的处理组中,加生物碳的2组处理组相较control组,NH4+离子浓度下降更快;NO3-离子浓度在前7天的所有处理中都很低,但是从7~14天期间除了control组,其它所有处理组中NO3-离子浓度都有显著增加,并且添加生物碳的处理组中,NO3-离子浓度要显著高于不添加生物碳的处理组。
在第7、14、25、45天时,对各个处理的样品中5个相关功能基因进行定量PCR检测,可知,生物碳的添加显著降低样品中古菌amoA基因丰度;尿素和生物碳的添加显著增加了各处理组7~14d中细菌amoA基因丰度;在第14d时4% biochar组中nirK基因丰度相较control组有显著增加;在第25d时,1% biochar和4% biochar组中nirS基因丰度相较control组有显著下降;nosZ的基因丰度在各个处理组中都呈现出类似的变化趋势,从7~14d明显下降,从14~25d明显上升,在第25d时达到最大峰值。
对Control、Urea、4%biochar及4%biochar+urea四个组的高通量测序结果进行PCoA分析,由图可知,不加生物碳和添加生物碳的处理组之间有明显的差异,并且Control和Urea的组间差异也大于组内差异。
对高通量测序结果中部分细菌amoA基因进行进化树的构建,我们发现AOB-amoA基因序列可分为三大集群,Nitrosospira clusters 12和13以及 Nitrosomonas cluster 6;其中Nitrosospira在4% biochar组中的相对丰度较Control组中有所降低,但Nitrosomonas却正好相反,它在添加生物碳的处理组中相对丰度反而有所增加。
总结
本研究从各个方面展开生物碳对稻田土壤温室气体N2O排放量影响的探究,将土壤理化性质、N2O排放量及土壤中微生物多样性组成情况等多角度研究结果相结合,阐明了生物碳对稻田土壤N2O排放的促进作用,为生物碳在农业生态中广泛应用提出了相左的坚实科学依据。
本研究的测序工作由上海派森诺生物科技股份有限公司完成。
文章索引:
Lin Y, Ding W, Liu D, et al. Wheat straw-derived biochar amendment stimulated N 2 O emissions from rice paddy soils by regulating the amoA genes of ammonia-oxidizing bacteria[J]. Soil Biology and Biochemistry, 2017, 113: 89-98
点击链接,阅读原文献:http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S003807171730514X?via%3Dihub