Oligo DNA的人工化学合成始于50年代初期,1980年,全自动的固相DNA合成仪面市后,使得快速合成Oligo DNA成为可能,这推动了生物工程技术的蓬勃发展。随着生物工程技术发展,人工合成Oligo DNA的需求量越来越大,已经成为分子生物学实验中基础的试剂之一。而合成Oligo DNA的质量,将会直接影响科研人员实验计划的顺利进行。因此, 使用高质量的合成Oligo DNA制品变得尤为重要。
引物合成Oligo DNA制品有如下特点:
1、合成高质量的DNA制品。
2、推出脱盐纯化、PAGE纯化、HPLC纯化三种级别制品,客户可根据实验需要选择。我们对每个制品都进行严格的质量管理。
3、制品包装中附有制品相关的多种数据,包括:合成的原始数据,A、G、C、T各碱基的分布情况,分子量,OD数,nmol数等,使用方便。
引物合成现在一般都采用亚磷酰胺化学合成Oligo DNA片段,具有快速偶联以及起始反应物比较稳定的特点。该方法是在固相载体上完成DNA链的合成的,合成时从3"→5"方向进行,通常3"端的第一个碱基结合在Glass担体(Controlled Pore Glass,CPG)上。Oligo DNA合成的原理基本相同,主要差别在于合成产率的高低、试剂消耗量和单个循环用时的不同。我公司采用的合成仪主要机型为ABI3900高通量合成仪。
合成的详细过程见图1,现简要说明如下:
图1 Oligo DNA合成原理图。N1代表第一个碱基,N2代表第二个碱基,依次类推。
第一步 | 三氯乙酸和预先连接在固相载体(CPG)上的第一个核苷酸反应(其活性基团处于被保护状态),脱去核苷酸5‘-羟基的保护基团DMT,获得游离的5‘-羟基; |
第二步 | 活化新的碱基单体(Phosphoramidite),准备与第一个碱基进行反应; |
第三步 | 合成DNA的原料(亚磷酰胺保护的核苷酸单体)与活化剂四氮唑混合,得到核苷亚磷酸活化中间体,它的3‘端被活化,5‘-羟基仍然被DMT保护,与溶液中游离的5‘-羟基发生缩合反应; |
第四步 | 带帽(capping)反应,缩合反应中可能有少数5‘-羟基没有参加反应(少于2%),用乙酸酐和1-甲基咪唑终止其后继续发生反应,这种短片段可以在纯化时分离掉; |
第五步 | 在氧化剂碘的作用下,亚磷酰形式转变为更稳定的磷酸三酯。(即将三价磷氧化成五价磷) (重复进行Step1~Step5的循环,直至合成完所需的Oligo DNA序列) |
第六步 | 合成结束后,将Oligo DNA分子从CPG上切下,再进行进一步的纯化。 |
引物合成过程中可以观察TCA处理阶段的颜色判定合成效率。连接在CPG上的引物被切下来,通过, PAGE等手段纯化引物,成品引物用C18浓缩、脱盐,测定OD260定量,根据订单要求分装。
(一)常规合成(≤60bp)
片段长度 | 纯化方式 | 规格 | 单价(元/碱基) | 发货周期(工作日) |
15-40bp | OPC | 2-5 OD | ¥1.20 | 2 |
10 OD | ¥1.80 | 2 | ||
30 OD | ¥4.00 | 3 | ||
50 OD | ¥8.00 | 3 | ||
15-60bp | PAGE | 2 OD | ¥1.60 | 3 |
5 OD | ¥1.80 | 3 | ||
10 OD | ¥2.20 | 3 |
(二)长链合成(>60bp)
片段长度 | 纯化方式 | 规格 | 单价(元/碱基) | 发货周期(工作日) |
61-80bp | PAGE | 2 OD | ¥4.00 | 3 |
5 OD | ¥6.50 | 3 | ||
10 OD | ¥8.00 | 3 | ||
81-100bp | PAGE | 1 OD | ¥8.00 | 3 |
(三)硫代修饰(SPO3)
产量(OD) | 发货时间(工作日) | 纯化方式 | 单价(¥) |
2 | 4 | PAGE | 8.00/base |
5 | 4 | PAGE | 12.00/base |
10 | 4 | PAGE | 15.00/base |
30以上 | 待询 | PAGE | 询价 |
(四)特殊碱基
种类 | 产量(OD) | 发货时间 | 纯化方式 | 单价(元/碱基) |
dI | 2 | 4 | PAGE | 80 |
5 | 4 | PAGE | 120 | |
dU | 2 | 4 | PAGE | 100 |
5 | 4 | PAGE | 140 | |
5甲基化dC | 2 | 4 | PAGE | 300 |
5溴dU | 2 | 4 | PAGE | 300 |
(五)修饰/标记引物
分类 | 修饰/标记 | 纯化方式 | 2 OD | 5 OD | 10 OD |
磷酸基团(Phosphorylation) | 5" PO4 | HPLC | ¥200.00 | ¥300.00 | ¥400.00 |
3" PO4 | HPLC | ¥300.00 | ¥350.00 | ¥500.00 | |
NH2修饰(Amino Linkers) | 5" or 3" NH2 C3 | HPLC | ¥450.00 | 询价 | 询价 |
5" NH2 C6 | HPLC | ¥200.00 | ¥300.00 | ¥450.00 | |
3" NH2 C7 | HPLC | ¥200.00 | ¥300.00 | ¥450.00 | |
5" NH2 C12 | HPLC | ¥450.00 | ¥600.00 | ¥800.00 | |
5" NH2 C6 dT | HPLC | ¥500.00 | ¥700.00 | ¥1,000.00 | |
3" NH2 C6 dT | HPLC | ¥350.00 | ¥500.00 | ¥800.00 | |
SH 修饰 (Thiolation) | 3" SH C3 | HPLC | ¥350.00 | ¥480.00 | ¥600.00 |
5" SH C6 | HPLC | ¥400.00 | ¥500.00 | ¥800.00 | |
Spacers | Spacer C3 | HPLC | ¥280.00 | ¥350.00 | ¥500.00 |
Spacer C6 | HPLC | ¥280.00 | ¥350.00 | ¥500.00 | |
Spacer 9 | HPLC | ¥280.00 | ¥350.00 | ¥500.00 | |
Spacer 18 | HPLC | ¥400.00 | ¥500.00 | ¥800.00 | |
dSpacer | HPLC | ¥500.00 | ¥700.00 | ¥1,000.00 | |
生物素(Biotin) | 5" Biotin | HPLC | ¥300.00 | ¥350.00 | ¥500.00 |
3" Biotin | HPLC | ¥350.00 | ¥400.00 | ¥600.00 | |
5" Biotin TEG | HPLC | ¥700.00 | 询价 | 询价 | |
3" Biotin TEG | HPLC | ¥600.00 | 询价 | 询价 | |
5" Dual Biotin | HPLC | ¥1,800.00 | 询价 | 询价 | |
5" or Internal Biotin dT | HPLC | ¥700.00 | ¥900.00 | ¥1,500.00 | |
5" PC Biotin | HPLC | ¥1,800.00 | 询价 | 询价 | |
地高辛(Digoxin) | 5" or 3" Digoxin | HPLC | ¥600.00 | ¥800.00 | ¥1,200.00 |
荧光基团(Fluorophores) | 5" Cy3 | HPLC | ¥1,200.00 | ¥1,500.00 | ¥2,500.00 |
3" Cy3 | HPLC | ¥1,300.00 | ¥1,600.00 | ¥2,600.00 | |
Internal Cy3 | HPLC | ¥1,400.00 | 询价 | 询价 | |
5" Cy5 | HPLC | ¥1,100.00 | ¥1,500.00 | ¥2,500.00 | |
3" Cy5 | HPLC | ¥1,000.00 | ¥1,800.00 | ¥2,600.00 | |
Internal Cy5 | HPLC | ¥1,400.00 | 询价 | 询价 | |
5" FAM | HPLC | ¥280.00 | ¥320.00 | ¥450.00 | |
3" FAM | HPLC | ¥300.00 | ¥350.00 | ¥500.00 | |
5" HEX | HPLC | ¥450.00 | ¥600.00 | ¥900.00 | |
5" TET | HPLC | ¥450.00 | ¥600.00 | ¥900.00 | |
5" 6-JOE | HPLC | ¥550.00 | ¥650.00 | ¥900.00 | |
3" 6-JOE | HPLC | ¥550.00 | ¥700.00 | ¥1,000.00 | |
5" Rox | HPLC | ¥500.00 | ¥600.00 | ¥900.00 | |
3" Rox | HPLC | ¥550.00 | ¥700.00 | ¥1000.00 | |
5" TAMRA | HPLC | ¥450.00 | ¥600.00 | ¥850.00 | |
3" TAMRA | HPLC | ¥500.00 | ¥650.00 | ¥950.00 | |
5" FITC | HPLC | ¥300.00 | |||
3" FITC | HPLC | ¥350.00 | |||
Internal TAMRA | HPLC | ¥1000.00 | 询价 | 询价 | |
淬灭基团(Quenchers) | 3" DABCYL | HPLC | ¥750.00 | ¥900.00 | ¥1,200.00 |
3" BHQ 1 | HPLC | ¥600.00 | ¥800.00 | ¥1,100.00 | |
3" BHQ 2 | HPLC | ¥600.00 | ¥800.00 | ¥1,100.00 | |
电化学标记(Electrochemicals) | Ferrocene | HPLC | ¥550.00 | ¥700.00 | ¥1,000.00 |
其它 | 电询 |
(六)双标记荧光探针
分类 | 标记 | 纯化方式 | 2 OD | 5 OD | 10 OD |
3" TAMRA | 5" FAM-3" TAMRA | 2次HPLC纯化 | ¥1,000.00 | ¥1,200.00 | ¥1,800.00 |
5" HEX-3" TAMRA | 2次HPLC纯化 | ¥1,400.00 | ¥1,600.00 | ¥2,000.00 | |
5" TET-3" TAMRA | 2次HPLC纯化 | ¥1,400.00 | ¥1,600.00 | ¥2,000.00 | |
5" JOE-3" TAMRA | 2次HPLC纯化 | ¥1,400.00 | 询价 | 询价 | |
3" DABCYL | 5" FAM-3" DABCYL | HPLC | ¥1,000.00 | ¥1,200.00 | ¥1,800.00 |
5" HEX-3" DABCYL | HPLC | ¥1,200.00 | ¥1,400.00 | ¥2,000.00 | |
5" TET-3" DABCYL | HPLC | ¥1,200.00 | ¥1,400.00 | ¥2,000.00 | |
5" JOE-3" DABCYL | HPLC | ¥1,300.00 | 询价 | 询价 | |
5" TAMRA-3" DABCYL | HPLC | ¥1,400.00 | 询价 | 询价 | |
5" Cy5-3" DABCYL | HPLC | ¥1,300.00 | ¥1,600.00 | ¥2,000.00 | |
3" BHQ1 | 5" FAM-3" BHQ1 | HPLC | ¥1,000.00 | ¥1,200.00 | ¥1,450.00 |
5" HEX-3" BHQ1 | HPLC | ¥1,200.00 | ¥1,400.00 | ¥1,800.00 | |
5" JOE-3" BHQ1 | HPLC | ¥1,100.00 | 询价 | 询价 | |
BHQ2 | 5" ROX-3" BHQ2 | HPLC | ¥1,000.00 | ¥1,300.00 | ¥1,800.00 |
ECLIPSE | 5" FAM-3" ECLIPSE | HPLC | ¥1,000.00 | ¥1,200.00 | ¥1,800.00 |
5" HEX-3" ECLIPSE | HPLC | ¥1,000.00 | 询价 | 询价 | |
5" TET-3" ECLIPSE | HPLC | ¥1,200.00 | 询价 | 询价 | |
5" JOE-3" ECLIPSE | HPLC | ¥1,100.00 | 询价 | 询价 | |
5" TAMRA-3" ECLIPSE | HPLC | ¥900.00 | ¥1,200.00 | ¥1,800.00 | |
5" Rox-3" ECLIPSE | HPLC | ¥900.00 | ¥1,200.00 | ¥1,800.00 | |
其它 | 电询 |
(七)、简并碱基及代码
简并代码 | M | R | W | S | Y | K | V | H | D | B | N |
代表碱基 | A/C | A/G | A/T | C/G | C/T | G/T | A/C/G | A/C/T | A/G/T | C/G/T | A/C/G/T |
* 价格可能会随市场有所波动,欢迎咨询当地销售!