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科研服务

ChIP-Seq

染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA 相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP 与二代测序技术相结合的ChIP-Seq 技术,能够检测全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。

ChIP-Seq 的原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA 片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的序列标签定位到基因组上,从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA 区段信息。


推荐平台

Ilumina HiSeq2000、 Ion Proton




生物信息分析

1. 原始数据整理、过滤及质量评估 
2. ChIP-Seq序列与参考基因组序列的比对
3. Peak Calling(统计每个样品的Peak片段信息)
4. Peak Annotation(根据已有的基因组数据库注释信息获得Peak位点信息)
5. Motif预测、基因集分析
6. 全基因组范围的峰值分布
7. 样品间差异Peak分析
8. 基因组水平和感兴趣区域的数据可视化


派森诺的优势

1.根据实际需求可个性化定制测序及分析方案。

2.严谨的实验流程和检测结果,数据分析结果可信。

3.分析结果的图表参考国际期刊设计,可直接用于文章写作。

4.与转录组等数据进行联合分析,挖掘生物信息资源。