真菌全基因组从头测序(Fungi Whole Genome de novo Sequencing),是指对基因组序列未知或无近缘物种基因组信息的某个物种,构建不同插入片段的基因组DNA文库并对文库进行序列测定,然后利用生物信息学方法进行拼接、组装和注释,从而获得该真菌的全基因组序列图谱。
产品参数
1、简单真菌:35% ≤ G+C% ≤ 65% 且杂合度 ≤ 0.5%且基因组 ≤ 40 Mb;
2、复杂真菌:G+C% > 65% 或 G+C% <35%或杂合度 > 0.5%或基因组 > 40 Mb;
Contig N50:将组装得到的 Contig 按序列长度从长到短排序并依次累加,当累加长度正好到序列总长度 50% 时,最后一条序列的长度。
样品要求
一、原样类
二、核酸类