微卫星(Microsatellite,MS)是指基因组中的短串联重复序列。与正常组织相比，肿瘤组织的微卫星由于重复单位的插入或缺失而导致微卫星长度的改变，就叫做微卫星不稳定性(Microsatellite Instability，MSI)。大量研究表明，MSI是由于错配修复(MMR)基因发生缺陷引起的，与肿瘤的发生密切相关。约15-20%的结直肠癌（CRC）主要是由MSI引起。 Lynch综合征，又称遗传性非息肉病性结直肠癌(HNPCC)，是由MMR基因胚系突变所致的显性遗传病。研究表明，90%以上的Lynch综合征具有MSI特征，而在散发性结直肠癌中MSI发生率约15%。NCI建议通过检测基因组上的5个单核苷酸重复的微卫星位点（NR-21，NR-24，BAT-25，BAT-26，MONO-27），来判断微卫星不稳定性程度。与正常组织相比，5个微卫星位点中2个或2个以上不稳定为高度微卫星不稳定（MSI-H）,1个位点不稳定为低度微卫星不稳定（MSI-L），5个位点均稳定则为微卫星稳定（MSS）。研究表明，Ⅱ期MSI-H结直肠癌患者可能预后良好且无法从5-FU的辅助化疗中受益。临床上已将MSI作为结直肠癌预后和制定辅助治疗方案的重要分子标志物，并应用于协助Lynch综合征筛查。
