扩增子/功能基因测序借助合适的类群特异性引物,可以检测菌群中特定种类/功能微生物的特征序列,反映菌群中该特定类群微生物的组成结构,从而发现它们的分布特征,阐明样本间多样性和组成差异,进而揭示该类群微生物中与差异相关联的关键成员。
项目流程
微生物组总DNA提取→目标片段PCR扩增→扩增产物检测定量→测序文库制备→上机进行高通量测序 →生信分析
产品特点
对特定种类/功能的微生物群落进行研究,比如产甲烷微生物、硝化/反硝化微生物等特定的微生物类群等,好比拿了一把“放大镜”,而消除了其它不相干微生物类群的干扰。
实验经验丰富:
样本类型全。涵盖动植物、土壤、水体等各类生境;
基因种类多。涵盖碳氮磷硫代谢、线粒体、叶绿体、重金属抗性等;
派森诺分析深入:
FrameBot校正。纠正移码错误,去除非目的序列;BROCC注释算法。替代BLAST,确保“真阳性”;NCBI-nt/nr数据库、功能基因限定参考子集。