题目:Single cell transcriptome profiling of retinal ganglion cells identifies cellular subtypes
期刊:Nature Communications
年份:2018
影响因子:12.353
本文重新定义了视网膜神经节细胞类型并且鉴定了对应的marker基因。
取出生后5天的小鼠左眼和右眼的视网膜,解离成单细胞悬液后进行免疫抗体包被筛选,筛选得到视网膜神经节细胞(retinal ganglion cells,RGCs)
通过聚类分析将6225个RGCs分成了40个亚群,这些RGCs均表达视网膜神经节细胞的marker基因Thy1与前期免疫抗体包被筛选结果一致,整体看这40个cluster的基因表达谱都比较相似,任意簇与簇之间的相关系数均大于0.9。下一步,作者鉴定了各亚群的marker基因,并通过免疫荧光原位杂交验证。
实验技术路线图
鉴定神经节细胞亚群
Cluster基因表达特征分析
Marker基因鉴定及原位杂交验证