Illumina NovaSeq X Plus
Illumina NovaSeq 6000
NextSeq™ 2000
Illumina MiSeq
MGI DNBSEQ-T7
NextSeq™ 500
PacBio Sequel II
PacBio Sequel
PacBio Revio
PromethION24
Chromium controller
Chromium X
Visium CytAssist
CytoFLEX SRT 细胞分选仪
Orbitrap Exploris™ 120
Orbitrap Astral
timsTOF UItra
Q Exactive HF-X
黄瓜是世界上重要的蔬菜之一，是研究韧皮部运输、性别测定和温度光周期生理的研究模型。茎尖是决定细胞命运和器官分生组织的重要的植物组织。在本研究中，作者通过小 RNA 测序获得黄瓜体内已知的及新的小 RNAs，使用 psRobot 和 TargetFinder 预测了它们的靶标，并通过降解组测序验证获得了靶基因的信息。经过靶基因差异表达及富集分析等预测了黄瓜茎尖组织中影响高温与低温、长与短光周期的关键 miRNA。
差异表达靶基因及其 miRNAs 的热图
miRNAs 与靶标的负相关模式
