绵羊大肠杆菌病是大型绵羊养殖场中常见的细菌性疾病之一。细菌性疾病的传统方法是通过抗生素治疗,尽管这种方法也有一些缺点。使用 RNA-seq 筛选拮抗绵羊大肠杆菌病的 CircRNA 是分析绵羊抗病性的分子机制并因此发现与抗病性状相关的候选基因的基础。 环状 RNA(CircRNA)是一种非编码 RNA(ncRNA),是一个新的研究热点,与 microRNA(miRNA)和长非编码 RNA(LncRNA)一起存在于 RNA 家族中。在这项研究中,我们给羔羊口服大肠杆菌,以获得拮抗和敏感的个体。我们使用 RNA-seq 筛选拮抗和敏感个体脾脏中的差异 CircRNA,以探讨 CircRNA 对绵羊抗腹泻的影响。
CircRNA 的长度, GC 含量和外显子数预测
拮抗和敏感的羔羊中差异表达的 CircRNA
DE CircRNAs 的 GO 与KEGG 富集分析