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全转录组测序

ceRNA 调控网路解析泡桐属植物疾病

长非编码 RNALncRNA)、环状 RNACircRNA)和微小 RNAMiRNA)在生命活动的调控中起着重要的作用。然而,它们在泡桐中的作用尚不清楚。识别 LncRNAs, CircRNAs, miRNA 通过对正常和被感染的泡桐丛枝病(Pawb)的RNA 序列分析,探讨了它们在泡桐病发病过程中的作用。总共鉴定出 3126 LncRNAs1634 CircRNAs 550 miRNAs。其中 229 LncRNAs65 CircRNAs 65 miRNAs 有显著差异表达。构造 ceRNA 网络由 5 miRNA4 CircRNA5 LncRNAs 15 mRNA 组成,它们在健康和感染的泡桐中均有不同程度的表达。本研究提供了泡桐中候选的 ceRNAs,揭示了 Pawb 的分子机制。

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健康和受感染植株的形态



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差异 RNA 分析统计



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构建 ceRNA 网络


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