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ChIP-Seq

Active medulloblastoma enhancers reveal subgroup-specific cellular origins

期刊: Nature

年份: 2016

影响因子: 41.456


简介:儿童后颅窝恶性胶质瘤——髓母细胞瘤(medulloblastoma)的发展可能是癌基因上游的启动子、增强子以及转录因子的表观调控所引起的;增强子调控靶基因的表达是通过顺式作用调控转录因子和染色质形成调控复合物,与此同时传递信号给RNA聚合酶来实现的;人类胚胎干细胞中可驱动基因表达的活性增强子有H3K4me1、H3K27ac和p300标记的染色质位点。


研究内容:

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研究结果: 鉴定到20,406 个差异的活性增强子;将H3K27ac的增强子富集结果与同一个TAD中的基因表达水平进行相关性分析,相关的基因认为是H3K27ac富集的增强子的靶基因;靶基因功能分析,表明细胞系样本与肿瘤样本之间存在表观遗传调控差异,而且髓母细胞瘤不同亚型的表观遗传机制也存在不同。


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在髓母细胞瘤亚组中差异调控的增强子

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超增强子对髓母细胞瘤的调控


原文索引:doi:10.1038/nature16546