针对动物线粒体基因组测序是否需要提供纯的线粒体基因组 DNA?
只需要提供全基因组总 DNA,不需要通过密度梯度离心等方法获得纯的线粒体DNA。
注意:每一种组织的线粒体 DNA 的含量不一样,取样时,尽量提供线粒体 DNA 含量丰富的组织或细胞,如肌肉组织。
如何从全基因组测序中获得线粒体 DNA?
一般来说,一个真核生物中包含M个线粒体细胞器,每一个线粒体细胞中包含N条线粒体基因组 DNA,核基因组数为 2,则线粒体基因组与核基因组的比例为 M*N:2。
采用生物信息学分析,将全基因组拼接结果中高覆盖度的序列提取出来,并与数据库进行比对分析,从而获得线粒体基因组 DNA。
植物的线粒体/叶绿体叶绿体基因组测序工作怎么准备样品?
植物的线粒体/叶绿体基因组大小比较大,一般我们都建议采用Illumina+Pacbio 来进行测序,对样品的需求就比较高,需要老师提供富集的线粒体DNA。常用的富集方法:超高速离心富集、富集线粒体/叶绿体DNA试剂盒等。