Illumina NovaSeq X Plus
Illumina NovaSeq 6000
NextSeq™ 2000
PacBio revio
MGI DNBSEQ-T7
PromethION 24
Chromium controller
Chromium X
Visium CytAssist
Xenium
MobiNova®-100
CytOFLEX SRT 细胞分选仪
Orbitrap Astral
timsTOF Pro
Orbitrap Exploris™ 120
Q Exactive HF-X
AB SCIEX QTRAP 6500+
LECO Pegasus HT TOFMS
1.ATAC-seq是否适合您?
ATAC能回答以下三个问题:
①找调控某一生物学过程的关键转录因子
②找哪个转录因子调控了我感兴趣的基因
③找我感兴趣的转录因子调控的靶基因
2.ATAC-seq与ChIP-seq异同点?
1.ATAC-Seq是在全基因组范围内检测染色质的开放区域,可以得到蛋白质的潜在结合位点,不依赖于抗体,一般用于不知道特定的转录因子。
2.ChIP-Seq是明确知道感兴趣的转录因子是什么,利用特异性抗体富集蛋白质及其结合的DNA片段,从而验证蛋白质与DNA的相互作用关系。