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科研服务

CircRNA测序

常见问题

  • 为什么CircRNA测序的研究比较热?

    1)多角度阐述分子生物学问题的需要;

    2)从新的角度发现导致样本存在差异的需要;

    3)寻找影响疾病发生的分子标记;

    4)探究circRNA的未知功能;

    5)寻找导致microRNA表达发生变化的机理。

  • CircRNA测序需要多少数据量?

    推荐10G clean data/样本的数据量。

  • CircRNA测序的条件?

    1. 有参考基因组,并且有CircRNA注释信息;

    2. 有相应的核糖体去除试剂盒。

  • CircRNA有哪些特点?

    1. 大多存在于细胞质中,且序列高度保守;

    2. 一般细胞或组织中,环状RNA较稳定,半衰期在48h,其他mRNA(线性)半衰期约为10h;血清中的外显子环状RNA不稳定,半衰期<15s。

    3. 不同细胞中表达的环状RNA可能不同;

    4. 同一个基因可能即产生线性mRNA,又可以转录成环状RNA;

    5. 总量估计,外显子环状RNA(exonic ciRcRNA)的量约为polyA mRNA(线性mRNA)的1%;占非核糖体RNA的0.8%;

    6. 大部分为ncRNA。