m6A甲基化常见修饰部位有哪些?
m6A倾向于分布在mRNA的蛋白质编码序列(CDS)、3′非翻译区(3′UTR)、终止密码子附近、剪切位点附近以及长的外显子区域,而且其修饰区域在人和鼠中具有很高的保守性;在microRNA靶位点及其邻近区域也有m6A富集。
常见的m6A甲基化修饰类型
mRNA甲基化测序有何技术优势?
能够直接对任意物种的转录组高甲基化片段进行测序,可无参。
能够在实际结合位点100-200个碱基范围内定位。
覆盖整个转录组范围的甲基化区域。
直接对甲基化片段进行定量和测序,不存在传统芯片杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题。