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科研服务

真核有参转录组测序

常见问题

  • 简述真核转录组常规建库流程

    1)通过磁珠和mRNA的polyA结构将mRNA分离出来;

    2)mRNA片段化;

    3)mRNA反转录为双链结构,第二链cDNA合成时,其中的碱基T,被替换成U,从而达到链特异性文库的目的;

    4)5’末端修复、3’末端加A;

    5)加接头;

    6)选择特异长度回收,一般为300bp;

    7)PCR;

    8)上机测序。


  • 如何对得到的数目较多的差异基因进行后期验证?

    首先根据GO或者KEGG富集结果,或者客户关注的基因,选取有代表性的进行qRT-RCR验证。然后根据RPKM值,选择RPKM值差异倍数答,同时p值小的基因进行qRT-RCR验证。