细胞悬液的制备过程中是否会影响基因的表达?
目前常用的方法中,不管是酶消化还是机械操作都会不可避免的对细胞产生影响,前者会使细胞产生应激反应,后者则容易损伤细胞,进而影响细胞活性。所以,在单细胞测序实验设计时,设置对照是非常重要的。前述的这些影响,在case和control中同样存在,我们关注case和control的差异表达基因,就可以去除实验的系统误差,找到决定感兴趣生物学过程的关键基因。
如何判断细胞类型?
细胞类型的判断是需要您自己选择Marker基因的,您可以参考同类物种或样本的已发表文章,或者根据数据库去确定Marker,比如CellMarker,panglao等。
10XGenomics单细胞平台有什么优势?
一.细胞通量高,一次可捕获上万细胞 ;
二.对细胞大小及类型限制低,且捕获效率达65% ;
三.从悬液到文库构建周期短。