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科研服务

细菌基因组重测序

信息分析内容



序 号

分析项目

类 别

分 析

备 注

1

  原始数据整理统计

A

2  数据质控A

3  高质量数据获取A

4  参考基因组整理A

5  序列比对分析A

6  序列比对结果统计A

7

SNP检测及注释

A



8

INDEL检测及注释

A



9

CNV分析

A



10

SV分析

A



11

非同义SNP及Indel的可视化

B



12

基于群体SNP的进化树重构

B



13

基于群体SNP的PCA分析

B



14

基因组序列拼接

B



15

基因组拼装效果评价

B


样 品 ≥ 3

16

全基因序列比对

B


样 品 ≥ 3

17

特有区域的功能分析

B


样 品 ≥ 3

18

外源插入片段检测

B


提供参考基因组

19

耐药位点检测

B


样品 ≥ 20,包含耐药和敏感型菌株

A:标准信息分析;                                                       B:高级信息分析。




分析结果展示



细菌基因组重结果展示.jpg