分析内容:
分析结果展示:
Peak Calling
对 Peak 注释分析结果中 Peak 在所覆盖的基因的功能性区域上的分布进行统计,并使用 ChIPseeker 包将统计结果绘制成每个样本分开查看的饼图如下:
Peak在功能元件上的分布
Peak 邻近基因GO富集柱状图
挑选了Peak邻近基因显著富集的GO条目中的前20条绘制柱状图进行展示:
Peak 邻近基因 GO 富集柱状图
差异Peak邻近基因Pathway富集柱状图和气泡图
差异Peak邻近基因Pathway富集气泡图
GO网络图分析
做完Pathway富集分析后,可能会得到几百甚至几千个富集到的Pathway条目, 为了有效的利用富集分析的结果,可以通过条目之间的关系找到处于更关键位置的Pathway条目:
GO网络图