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科研服务

ATAC-seq

分析内容:

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分析结果展示:


Peak Calling

对 Peak 注释分析结果中 Peak 在所覆盖的基因的功能性区域上的分布进行统计,并使用 ChIPseeker 包将统计结果绘制成每个样本分开查看的饼图如下:


 

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Peak在功能元件上的分布


 

Peak 邻近基因GO富集柱状图

挑选了Peak邻近基因显著富集的GO条目中的前20条绘制柱状图进行展示:

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Peak 邻近基因 GO 富集柱状图


 

差异Peak邻近基因Pathway富集柱状图和气泡图

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差异Peak邻近基因Pathway富集气泡图


GO网络图分析

做完Pathway富集分析后,可能会得到几百甚至几千个富集到的Pathway条目, 为了有效的利用富集分析的结果,可以通过条目之间的关系找到处于更关键位置的Pathway条目:

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GO网络图