分析项目 | 类别 | 分析 | 备注 | |
1 | 原始数据整理 | A | √ | |
2 | A | √ | ||
3 | A | √ | ||
4 | A | √ | ||
5 | Unigene 聚类 | A | √ | |
6 | Unigene 功能注释 | A | √ | |
7 | Unigene GO 分类注释 | A | √ | |
8 | Unigene eggNOG分类注释 | A | √ | |
9 | Unigene KEGG分类注释 | A | √ | |
10 | Unigene 表达量计算 | A | √ | |
11 | Unigene表达量密度分布 | A | √ | |
12 | Unigene测序饱和度分析 | A | √ | |
13 | Unigene覆盖均一度分析 | A | √ | |
14 | A | √ | 需要有生物学重复 | |
15 | A | √ | 提供分组信息 | |
16 | 表达差异 Unigene GO富集分析 | A | √ | |
17 | 表达差异 Unigene GOSlim富集分析 | A | √ | |
18 | 表达差异 Unigene KEGG富集分析 | A | √ | |
19 | A | √ | 样品数 ≥ 3 | |
20 | A | √ | ||
21 | cSNP 分析 | A | √ | |
22 | InDel 分析 | A | √ | |
23 | SSR 分析 | A | √ | |
24 | ORF 分析 | A | √ | |
25 | B | 实验分组 ≥ 3 | ||
26 | B | √ | ||
27 | B | 默认做植物物种 | ||
28 | B | 样品数 ≥ 20 | ||
29 | B | √ | 提供分组信息 |
图1 NR注释统计
图2 KEGG注释
图3 差异表达基因聚类
图4 SNP 和 InDel 统计
