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科研服务

动植物基因组全长测序

动植物基因组分析内容


序号

分析项目

1

下机数据统计

2

数据质控

3

数据获取

4

Survey 分析

5

基因组拼装

6

基因组拼装效果评价

7

基因组拼装完整性与连续性评估

8

重复序列分析

9

非编码 RNA 预测

10

蛋白编码基因预测

11

蛋白编码基因的序列比对

12

蛋白编码基因的 GO 注释

13

蛋白编码基因的 eggNOG 注释

14

蛋白编码基因的 KEGG 注释

15

蛋白编码基因的 Swiss-Prot 注释

16

序列比对分析

17

SNP 分析

18

InDel 分析

19

种群统计学分析

20

基因家族分析

21

Venn 绘制

22

单拷贝基因的蛋白序列一致性分析

23

基因家族扩张和收缩分析

24

dNdS 分析

25

基于全基因组单拷贝基因的进化树重构

26

分歧时间估算

27

基因组数据上传