样本 | 测序样本要求 |
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动植物组织 | 组织鲜重 0.2g,只记有效组织细胞重量 |
真菌 | 菌体、菌丝、孢子粉等湿重 0.2g |
动植物和酵母细胞 | 5-10x106个细胞 |
新鲜血液(抗凝) | 250μl |
总RNA | 总量>5µg/文库,C>300ng/ul,RIN≥8 |
序号 | 测序分析项目 |
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1 | 原始数据整理、过滤及质量评估 |
2 | 插入片段质量控制 |
3 | 转录本分类 |
4 | 转录本聚类与校正 |
5 | 参考基因组注释整理与统计 |
6 | 比对结果统计 |
7 | 功能注释(GO、KEGG等) |
8 | 融合基因分析 |
9 | 基因结构优化 |
10 | SNP分析 |
11 | 可变剪切分析 |
12 | UTR分析 |
13 | 新转录位点分析 |
14 | 基因表达量统计 |
15 | 基因表达差异分析 |
16 | 表达差异基因GO富集分析 |
17 | 表达差异基因KEGG通路富集分析 |
18 | 表达差异基因聚类分析 |