The RNA Binding Protein Quaking Regulates Formation of circRNAs
研究背景
关于circRNA的作用功能已有较多报道，但关于circRNA的形成机制等问题并没有较多的研究。
研究目的
通过高通量测序和蛋白组学等手段，对人HMLE细胞系细胞和发生上皮间质转化（epithelial-mesenchymal transition，EMT）后的mesHMLE细胞进行了研究。
研究结果
发现EMT过程中大量的circRNA的形成会受到RNA结合蛋白QKI的动态调控，并且证实插入QKI蛋白结合位点的正常线性剪接体也会形成新的circRNA结构。这些发现表明了circRNA在EMT即上皮间质转化中发挥着特定的生物学作用。
图1 全转录组的总circRNA和来源于无差异高丰度转录本的circRNA的分布比例
图2 circRNA及其同源线性mRNA的丰度差异倍数的相关性
图3 circRNA在HMLE（上皮细胞）和 mesHMLE（间质化细胞）中的相对丰度
Conn S. et al. The RNA Binding Protein Quaking Regulates Formation of circRNAs. Cell, 2015, 160(6): 1125-1134.
