研究背景
m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）是真核生物mRNA内部序列中常见的一种甲基化修饰，同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A的研究发现开辟了真核生物转录后基因调控的新领域。本文利用MeRIP-seq测序技术展示了m6A作为RNA表观遗传标记在哺乳动物免疫系统中发挥的重要作用，该技术对于RNA甲基化表观转录组学研究提供了有力工具。
试验方法
供试样本：
正常小鼠和CD4-Cre Mettl3fl/fl 条件性敲除小鼠。分别取CD4+CD25-CD45RBhi Naive T 细胞转输至 RAG2-/- 小鼠体内， 进行小鼠慢性肠炎诱导处理。
测序原理：
200 ng RNA与1ug m6A特异性抗体进行免疫共沉淀，对富集下来的、具有m6A修饰的RNA片段进行高通量测序和生物信息学分析。
测序平台：
Illumina HiSeq2500 ，2 * 75 bp
数据量：
per million reads/sample
结果解读
MeRIP-seq和qPCR验证结果显示，KO 小鼠 Naive T 细胞中，细胞因子信号抑制分子（SOCS）家族的 mRNA 水平显著上调（图1）。同时对SOCS1和SOCS3的MeRIP-seq结果表明m6A修饰位点，并主要分布在3’UTR区域（图2）。
图1 MeRIP-seq甲基化位点分析
图2 MeRIP-seq qPCR验证结果
原文索引：
Hua-Bing Li, Jiyu Tong, Shu Zhu et al. m6A mRNA methylation controls T cell homeostasis by targeting the IL-7/STAT5/SOCS pathways. Nature, Published online 09 August 2017, doi:10.1038/nature23450
