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科研服务

全长转录组测序

Exploiting single-molecule transcript sequencing for eukaryotic gene prediction

期刊： Genome Biology

年份： 2015

影响因子：10.81


简介：提供一个新的方法，通过PacBio RS平台对甜菜进行转录组测序，获得全长转录本。98%的full-insert SMRT reads包含完整的开放阅读框（ORF），并进行自动化的开发；将测序结果同二代测序结果进行比较，灵敏度和准确度有大幅提高，也为完善甜菜的基因组提供参考依据。


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图1  转录本长度描述



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图2  mRNA序列覆盖统计


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图3  分析流程描述


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图4  基因结构分析



结果：1.1M subreads合并到78,965个环化一致分子（CCS）中，626,871个subreads未做拆分；表明SMRT技术适用于识别基因序列模型，并将结果与二代测序结果比较，证实PacBio RS平台所具有的优势。