CUT&Tag技术应用？
应用于表观遗传学领域的蛋白质与DNA互作研究
研究转录因子在全基因组上的结合或分布位点
研究组蛋白修饰在全基因组上的分布位点
研究转录因子下游调控的靶基因
抗体应该如何选择？
CUT&Tag的数据产出主要取决于样本量、一抗特异性和一抗的靶点丰度。一抗需要客户提供商品化的ChIP级别的一抗原液， 项目结束后可寄还剩余一抗。如需公司提供二抗，则限定鼠/兔源的一抗，如无需使用公司二抗，则需要老师提供二抗。
CUT&Tag和ChIP-seq，该如何选择？
植物以外的物种，无论是组织样本还是细胞样本，推荐CUT&Tag ，相对来说CUT&Tag具有更高的成功率和信噪比；植物样本，推荐ChIP-seq。植物样本提核困难，不适合CUT&Tag。
CUT&Tag和ChIP-seq有什么区别？
从建库流程角度，CUT&Tag要求的细胞起始量远低于ChIP-seq，不需要对样本进行甲醛交联，使用beads吸附活细胞的状态下先进行一抗孵育，后使用Tn5转座酶切割片段并添加接头，且无需后续的解交联步骤。即样本起始量、样本状态、抗体孵育、核酸片段化等步骤原理和ChIP-seq均不相同。从结果上看，CUT&Tag的数据信噪比更好，可重复性更好。
做CUT&Tag实验的时候，阴性对照和阳性对照怎么设置，作用是什么?
与 ChIP 不同，该实验方案不需要 input 样本，但需要添加阴性对照和阳性对照。针对抗体的阳性对照可以采用RNA Pol II/组蛋白，证明系统没有问题。阴性对照使用与一抗相同种属的IgG，阳性对照，阴性对照证明抗体特异，实验结果可信。
客户有动物组织，建议消化成原代细胞送样还是将组织冻存送样？
建议寄送冻存组织。CUT&Tag对细胞的活性要求较高，原代细胞通常活性偏低，冻存复苏后的细胞活性很难达到送样要求，建议将新鲜组织清理冻存，及时送样。
CUT&Tag接收样本的物种有什么要求?
CUT&Tag适用于哺乳动物细胞的蛋白-DNA互作研究，酵母、植物等细胞需要经过(破除细胞壁或者提取细胞核)来进行实验。CUT&Tag在哺乳动物细胞系上的应用比较成熟，动物组织经过处理得到悬浮单个细胞同样可以进行实验。
