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科研服务

真核有参转录组测序

分析内容


序号

分析项目

类别

分析

备注

1.         

原始数据整理、过滤及质量评估

A


2.         

参考基因组注释整理与统计

A


3.         

比对结果质控

A


4.         

基因表达量统计

A


5.         

测序饱和度分析

A


6.         

基因覆盖均一度分析

A


7.         

样品相关性检验

A


内部生物学重复之间

8.         

基因表达模式分布

A


样品数 ≥3

9.         

基因表达差异分析

A

样品数≥2

10.      

差异表达双向聚类分析

A


基因或样品≥3

11.      

PCA分析

A


12.      

表达差异基因GO富集分析

A


13.      

表达差异基因KEGG通路富集分析

A


14.      

表达差异基因聚类分析

A


15.      

cSNP分析

A


16.      

可变剪切分析

A


17.      

UTR分析

A


18.      

新转录位点分析

A


19.      

组间共有特有差异基因可视化

B


实验分组≥3

20.      

转录组可视化平台搭建

B


提供客户软件及使用方法

21.      

转录本表达差异分析

B


需要有生物学重复

22.      

外显子表达差异分析

B


需要有生物学重复

23.      

蛋白网络互作分析

B

客户提供关注蛋白

24.      

基因组圈图

B


要求基因组完成图

25.      

共表达网络分析

B


样品数≥20



真核有参转录组测序2.png

图1 样品相关性检验 


真核有参转录组测序3.png

图2 基因差异表达火山图 



真核有参转录组测序4.png

图3 不同组间的差异



真核有参转录组测序5.png 

图4 基因有向无环图