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CircRNA测序

CircRNA测序介绍

CircRNACircular RNA),是一类不具有 5' 末端帽子和 3' 末端 polyA)尾巴、并以共价键形成稳定闭合环状结构的非编码 RNA 分子。 CircRNA 广泛存在于生物细胞中,对 miRNA 起重要的调控作用,进而调控基因表达。随着高通量测序技术的发展, CircRNA 在多种真核生物体内被大量鉴定出来,利用高通量测序技术,对生物样本中的CircRNA 进行鉴定、表达丰度检测及结构分析,是 RNA 领域的研究热点,推动更深入的基因表达研究。



CircRNA测序方案设计

CircRNA 实验设计思路为差异比较,常见的类型为实验组与对照组(case VS control),进行两两比较;若考虑时空因素,如按照不同生长发育阶段或者疾病发生发展整个过程进行比较,即进行多重比较分析,然后对差异的CircRNA 来源基因进行预测和富集分析。一组样品建议至少 6 个生物学重复。